Après avoir fini le jeu Greed Island, Gon et Kirua partent à la rencontre de celui qu’ils espèrent être Ging, le père de Gon. Mais il s’agit en fait de Kaito, l’un de ses disciples. Pendant ce temps, la reine d’une espèce de fourmis bien particulière – les fourmis-chimères – donne naissance à des sujets de plus en plus forts dans l’espoir de voir son espèce conquérir le monde… Gon, Kaito et Kirua parviendront-ils à venir à bout des fourmis-chimères avant la naissance du roi ?