L’alliance Ninja est toujours confrontée aux shinobis ressuscités par la technique de la réincarnation des âmes. Le trio Ino-Shika-Chô parvient non sans mal à sceller Asuma. Au même moment, Madara fait son apparition sur le champ de bataille et invoque la statue de l’Hérétique. Les dégâts qu’elle cause sont terribles!

Naruto qui continue à parfaire sa maîtrise du chakra de Kyûbi, a un mauvais pressentiment. Il décide de sortir de la salle spéciale d’entrainement, et découvre avec effroi, que ses amis sont en guerre.

Accompagné de Bee, il prend part à la bataille. Son objectif : terrasser Madara, et ainsi protéger tous ses amis. Mais c’est sans compter sur l’avis du Raikage qui compte bien le stopper…